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TRADIGO GIUSEPPE
Docenti di ruolo di IIa fascia
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SISTEMI INFORMATIVI GEOGRAFICI
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Linee di ricerca (21)
Conferenza su invito al Corso di Dottorato di Chimica Farmaceutica tenuto dal Prof. Stefano Alcaro con un intervento dal titolo “Machine Learning approaches for contact maps prediction in CASP experiment” sul problema del folding delle proteine con l'uso di mappe di contatto predette con reti neurali ricorrenti
Contratto di ricerca presso l'ICAR-CNR, Istituto per il Calcolo e le Reti ad Alte Prestazioni - Consiglio Nazionale delle Ricerche, Rende IT. Ha contribuito alla definizione e all'implementazione dei moduli in un prototipo software basato su Globus per il grid computing per la gestione di dati a flusso da sensori
Contratto di ricerca presso l'Università Magna Graecia di Catanzaro, Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche sul progetto: “Algoritmi per l'analisi di dati spaziali e sistemi GIS”
Contratto presso l'ICAR-CNR, Istituto per il Calcolo e le Reti ad Alte Prestazioni - Consiglio Nazionale delle Ricerche, Rende, IT, progetto sulle Griglie Computazionali
Contratto presso l'IRPI-CNR, Istituto per le Ricerche e la Protezione Idrogeologica - Consiglio Nazionale delle Ricerche, Rende, IT, in un progetto relativo allo sviluppo di un software web-based per il telerilevamento e la gestione dei dati ambientali per l'acquisizione, l'elaborazione e la visualizzazione dei dati dei sensori, acquisiti da una rete di sensori GSM/satellitare distribuita, per il monitoraggio remoto dei dati dei fronti di frana sul territorio
Direttore Ricerca e Sviluppo presso South Ventures Inc., una startup della Silicon Valley, dove era responsabile dell'innovazione dell'azienda. Ha scritto progetti e vinto finanziamenti della Comunità Europea, per un valore di 300.000 euro, per realizzare un sistema di Analytics per il servizio geolocalizzato denominato Soundtracker, una radio digitale, di cui ha coordinato le fasi di ricerca, pianificazione e realizzazione del progetto
Ha guidato le attività di ricerca e sviluppo tra Relatech S.P.A., una società ICT, ed i suoi partner di ricerca, partecipando attivamente alla progettazione e pianificazione di una serie di progetti innovativi di ricerca industriale tra cui orchestrazione di microservizi, integrazione di dati e piattaforme di intelligenza artificiale
Ha partecipato ad una collaborazione scientifica sotto la supervisione del Prof. C. Indolfi, Direttore del Dipartimento di Emodinamica dell'Università di Catanzaro, IT, dove ha progettato e implementato uno strumento software per l'analisi pre-impianto del posizionamento dello stent, a supporto delle procedure di chirurgia angioplastica . Il sistema è attualmente in uso nella sala operatoria del reparto di emodinamica
Ha partecipato al IX e al X concorso internazionale CASP (Critical Assessment of protein Structure Prediction) nel 2010 e nel 2012 rispettivamente, con un progetto congiunto tra l'AmMBio Lab. presso l'University College di Dublino, guidato dal Prof. Gianluca Pollastri, e il Laboratorio di Bioinformatica presso l'Università degli Studi di Catanzaro. Il sistema XXStout è un insieme di modelli di reti neurali ricorsive 2D addestrati per prevedere mappe di contatto proteico multiclasse. In particolare ha studiato l'uso di carbonio-α, carbonio-β, mappe di contatto di 2 e 4 classi e l'uso della distanza mappe per migliorare la previsione della struttura proteica tridimensionale sia per le proteine basate su modello che per quelle ab-initio. Il sistema proposto è stato presentato alla conferenza internazionale CASP9 tenutasi ad Asilomar, Pacific Grove, California nel dicembre 2010. Il server XXStout si è classificato terzo tra i 32 server ab initio partecipanti al CASP 2010. Lo stesso server ha ottenuto il primo posto tra i predittori nativi nel CASP 2012
Ha partecipato al progetto COFIN, lavorando alla progettazione e all'implementazione di MS-Analyzer, uno strumento software per il pre-processing di dati di spettrometria di massa
Ha partecipato al progetto FIRB (piattaforme software abilitanti per il grid computing ad alte prestazioni), dove ha progettato e implementato uno strumento per la gestione di dati a flusso da sensori in ambiente grid su Globus,una piattaforma abilitante per il Grid Computing
Ha partecipato al progetto P2P-CKMS-SSDM (modelli collaborativi e tecnologie a supporto di sistemi clinici distribuiti), finanziato con fondi europei POR, presso l'Univ. di Catanzaro, IT, Dip. di Medicina e Medicina Clinica. Ha partecipato alla progettazione e implementazione di SIGMCC, un sistema software basato su tecnologia peer-to-peer che consentiva lo scambio di informazioni tra reparti di oncologia
Ha partecipato al progetto di ricerca “LOGICA”, presso l'Università degli Studi di Catanzaro, Dipartimenti di Informatica e di Scienze e Storia del Diritto, dove ha progettato e realizzato un prototipo software per flussi continui di dati provenienti da sensori (sensor data streams) come componente di un più ampio sistema per la gestione del porto commerciale di Gioia Tauro
Ha partecipato al progetto “MESSIAH” (MEthodologieS, tools and ServIce for underwater ArcHeology, metodologie, strumenti e servizi per l'archeologia subacquea) presso Università di Catanzaro, IT, Dip. di Medicina Sperimentale e Clinica
Ha progettato e implementato un sistema informativo geografico per dati clinici denominato GeoMedica, per coadiuvare i medici nella scoperta di correlazioni tra dati clinici ed aree geografiche (es. siti inquinanti, sorgenti radio, linee costiere).
In collaborazione con ICS S.r.l., società di consulenza tecnico professionale nel campo delle energie rinnovabili, delle tecnologie e dell'ingegneria ambientale, ha curato e tenuto un corso su “L'uso dei droni in emergenza per la gestione degli incendi e il controllo del territorio” presso il Consorzio di Bonifica Integrale dei Bacini del Tirreno Cosentino, Praia a Mare, IT.
Postdoc al DIMES, Dipartimento di Informatica, Modellistica, Elettronica e Sistemistica dell'Università della Calabria, progetto: “PON BA2Know - Business Analytics to Knowledge”
Postdoc al DIMES, Dipartimento di Informatica, Modellistica, Elettronica e Sistemistica, Università della Calabria, progetto: “PRIN 2010 Data-Centric Genomic Computing (GenData 2020)”, dove ha partecipato al progetto europeo PRIN Data-Centric Genomic Computing (GenData 2020) dove ha progettato e implementato un predittore per strutture G-Quadruplex DNA/RNA
Postdoc presso DIMES, Dipartimento di Informatica, Modellistica, Elettronica e Sistemistica, Università della Calabria, con una borsa di studio del progetto europeo “PON01 02833 CARDIOTECH”, dal titolo “Modellazione e integrazione di dati biologici e clinici a supporto dei processi decisionali in cardiologia” dove ha progettato e realizzato un sistema software in grado di acquisire ed eseguire l'analisi del segnale di pressione arteriosa differenziale nella sala operatoria di emodinamica
Ricerca su vari aspetti della pandemia da SARS-CoV-2 (Covid-19)
Visiting Research Fellow presso il Diparimento di Epidemiologia, Università della Florida, progetto: “Endotype discovery in prostate cancer and multi-domain analysis of age-related comorbidities”, dove ha lavorato a un progetto sul cancro alla prostata in cui vengono creati modelli di reti di comorbilità da un ampio database di caratteristiche fenotipiche e genotipiche con analisi GWAS (Genome-Wide Association Study). Ha inoltre presentato finanziamenti, sia ai bandi NFS (National Science Foundation) che NIH (National Institutes of Health), per lo studio di particolari ripiegamenti del DNA/RNA, chiamati G-quadruplex, che sono promettenti siti di legame per farmaci e possono agire come dispositivi molecolari per inibire geni legati a patologie note
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Pubblicazioni (91)
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Pubblicazioni (cartacee e digitali) dedicate al pubblico non accademico (Organizzatore)
- Articolo intitolato "Grass 5: un GIS Open Source", pubblicato sulla rivista generalista Linux Magazine, Edizioni Master.
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